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14項研究成果亮相AACR年會,泛生子原研技術(shù)開發(fā)能力備受關(guān)注

2020-07-01 17:26:06   來源:投資家網(wǎng)  作者: 

摘要:2020年6月24日美國癌癥研究協(xié)會(AACR)年會閉幕。

2020624日美國癌癥研究協(xié)會(AACR)年會閉幕。剛剛于619日在納斯達克達成全球癌癥精準醫(yī)學領(lǐng)域最大IPO的泛生子(Nasdaq: GTH),在會議期間發(fā)布了14項國際領(lǐng)先的臨床研究成果,其多項原研技術(shù)的性能及被廣泛應用在多個癌種備受關(guān)注。而這些基礎科研和技術(shù)創(chuàng)新的優(yōu)勢,也被學術(shù)圈之外的投資者看做是其未來商業(yè)化發(fā)展的強勁動力,畢竟對于泛生子這樣的科創(chuàng)企業(yè)的來說,原研技術(shù)開發(fā)實力才是發(fā)展內(nèi)核。

 


文章題目

Abstract   Number

1

Genetic profiling of   cerebrospinal fluid cfDNA from NSCLC patients with leptomeningeal metastases   reveals EGFR-TKIs resistant mutations independent of extracranial lesions

723

2

Prognostic implications of   tumor CD47 expression and tumor-associated macrophages in non-small cell lung   cancer

2628

3

Chromosomal Instability of   Circulating tumor DNA Predicts Response to Neoadjuvant Chemotherapy in   Gastric Cancer

1991

4

Tumor Mutation Burden   combined with Tumor Markers as Predictive Prognostic Biomarkers for   Neoadjuvant Chemotherapy in Patients with Gastric Cancer

3832

5

An amplicon sequencing   based all-in-one genetic testing panel for molecular classification and   guiding individualized treatment of brain cancer

743

6

NF-KB participates in   regulation of immune infiltrates in glioma

2751

7

Methylation MGMT gene   promoter analysis based on a high throughput method combines bisulfite   conversion with amplicon sequencing

3186

8

Mechanism of natural   progression from low grade glioma to glioblastoma: A case report

5938

9

Molecular-Subtype-Specific   Biomarkers Improve Prediction of Temozolomide Therapy in Low Grade Gliomas

7999

10

A Multicenter, Prospective   Evaluation of Urine-Based ctDNA Assay for Urinary Cancers Diagnosis

2296

11

A Urine-based liquid biopsy   Method for Detection of upper tract urinary carcinoma

3608

12

Comprehensive   characterization of non-reference allele occurring in high throughput   sequencing of tumor sample

2110

13

Combining targeted   sequencing and ultra-low pass WGS for accurate SCNA detection on tumor sample   of biased aneuploidy

2671

14

Targeted RNA-Capseq   provides new insight into clinical fusion detection

5181

 

美國癌癥研究協(xié)會年會(AACR)是全球首屈一指的癌癥研究學術(shù)會議。作為世界上創(chuàng)立最早、規(guī)模最大的專注于癌癥研究的科學組織,美國癌癥研究協(xié)會年會匯集了全球癌癥診療領(lǐng)域最前沿的研究成果。受全球新冠疫情影響,今年大會選擇以線上網(wǎng)絡會議這一特殊形式舉辦。

 

據(jù)了解,在本次AACR網(wǎng)絡年會上,泛生子與中國十余家頂尖腫瘤醫(yī)院及研究中心合作的研究成果,包括中國醫(yī)學科學院腫瘤醫(yī)院、301醫(yī)院、北京天壇醫(yī)院等。而這些研究成果覆蓋肺癌、腦癌、胃癌、泌尿系統(tǒng)腫瘤等多個高發(fā)癌種,其中涉及液體活檢、癌癥早篩、融合基因檢測等熱門前沿技術(shù),并在膠質(zhì)瘤、尿路上皮癌、腦膜轉(zhuǎn)移瘤等癌種的研究中取得了關(guān)鍵技術(shù)突破,其中重要的數(shù)據(jù)產(chǎn)出也填補了部分研究領(lǐng)域的空白。

 

合作醫(yī)院

中國人民解放軍總醫(yī)院(301醫(yī)院)、中國醫(yī)學科學院腫瘤醫(yī)院、首都醫(yī)科大學附屬北京天壇醫(yī)院、中山大學附屬第六醫(yī)院、北京大學國際醫(yī)院、陸軍軍醫(yī)大學第一附屬醫(yī)院、上海仁濟醫(yī)院等

涉及癌種

肺癌、胃癌、腦腫瘤、泌尿系統(tǒng)腫瘤等

研究領(lǐng)域

精準診斷、新輔助化療預后及療效評估、免疫治療、耐藥監(jiān)測等

關(guān)鍵技術(shù)

一步擴增技術(shù)(“一步法”)、液體活檢低頻突變檢測技術(shù)、高級機器學習技術(shù)(生物信息算法優(yōu)化)、未知融合基因檢測技術(shù)等

 

眾所周知,納斯達克偏愛技術(shù)研發(fā)能力強的科創(chuàng)型企業(yè)。科創(chuàng)企業(yè)能否受到國際資本的青睞,就在于它能否開發(fā)出有引領(lǐng)和推動行業(yè)發(fā)展的明星技術(shù)。

 

泛生子自主研發(fā)的“一步法”專利技術(shù),在先進性、實用性方面都居于國際領(lǐng)先水平,并因極強的可拓展性賦能眾多技術(shù)平臺,不斷刷新著國內(nèi)外專業(yè)人士的認知和期待。

 

在此次會議中,泛生子公布了依托“一步法”原研技術(shù)開發(fā)的腦癌檢測產(chǎn)品的臨床研究數(shù)據(jù)。該產(chǎn)品將膠質(zhì)瘤相關(guān)多個驅(qū)動基因和1p/19q共缺失變異合并檢測,與常規(guī)檢測方法相比,所需檢測樣本更少,且結(jié)果高度一致。在另一個研究中,泛生子與研究團隊依托“一步法”巧妙地將亞硫酸氫鹽轉(zhuǎn)換與MGMT基因啟動子的擴增子測序相結(jié)合,以分析MGMT啟動子甲基化狀態(tài),與金標準檢測方法結(jié)果一致率高達94.4%。據(jù)悉,泛生子已基于一步法技術(shù)開發(fā)了一系列的產(chǎn)品,涵蓋除腦癌在內(nèi)的膀胱癌和肺癌液體活檢、甲狀腺癌細針穿刺檢測等。

 

利用液體活檢技術(shù)進行癌癥診斷及早篩,是近年癌癥精準醫(yī)療領(lǐng)域非常熱門的研究方向。但作為新興技術(shù),國內(nèi)外獲批的液體活檢產(chǎn)品還寥寥可數(shù)。而作為國內(nèi)該領(lǐng)域頭部企業(yè),泛生子已經(jīng)推出了多個液體活檢服務和產(chǎn)品,用于癌癥診斷、早期檢測和監(jiān)測。其中泛生子研發(fā)的液體活檢低頻突變檢測技術(shù),可檢測罕見基因突變,為DNA添加獨特身份標記接頭(Barcord),有效濾除PCR擴增和NGS測序所產(chǎn)生的假陽性錯誤,以實現(xiàn)高保真檢測低頻突變。此外,液體活檢低頻突變檢測技術(shù)結(jié)合“一步法”可大幅減少文庫構(gòu)建過程中原始ctDNA分子的損失,提高高靈敏度和特異性,并能在血液、腦脊液、尿液等多種樣本中應用。

 

相比傳統(tǒng)的文庫構(gòu)建和富集實驗技術(shù)的十多個復雜步驟,“一步法”只需要一輪PCR反應,最大限度地減少了操作時間和污染風險,將文庫構(gòu)建的總時間降低到1.5小時,相比傳統(tǒng)的雜交捕獲建庫技術(shù)的24個小時和多重PCR建庫技術(shù)的8 個小時大為縮減,使其更加方便低成本地在醫(yī)院內(nèi)部運行。

 

image.png

人類8基因突變聯(lián)合檢測試劑盒(國械注準20203400072),首款獲批搭載泛生子“一步法”的肺癌臨床診斷試劑盒,一次性檢測與非小細胞肺癌患者靶向治療密切相關(guān)的8個基因突變和融合—EGFR / ALK / ROS1 / BRAF / KRAS / HER2 / MET / PIK3CA

 

此次AACR匯集的眾多研究成果中,泛生子基于腦脊液、尿液樣本對腦膜轉(zhuǎn)移瘤、尿路上皮癌的研究非常值得關(guān)注。

 

EGFR突變陽性的非小細胞肺癌患者更易發(fā)生腦膜轉(zhuǎn)移,而發(fā)生腦膜轉(zhuǎn)移的患者預后較差。雖然EGFR-TKIs治療能顯著提高患者的總生存率,但許多患者不可避免地產(chǎn)生獲得性耐藥,這對伴有腦膜轉(zhuǎn)移的非小細胞肺癌患者的治療是一個巨大的挑戰(zhàn)。近年來,研究顯示腦脊液cfDNA比血漿cfDNA更能體現(xiàn)腦膜轉(zhuǎn)移患者的基因突變狀態(tài)。基于此,研究團隊基于對腦脊液及外周血樣本,對31名攜帶EGFR突變,且在被診斷為腦膜轉(zhuǎn)移瘤(LM)之前至少接受了6個月EGFR-TKIs治療的非小細胞肺癌腦膜轉(zhuǎn)移患者進行檢測。結(jié)果表明,與既往研究一致,原發(fā)灶所有驅(qū)動基因突變均在腦脊液cfDNA中檢測到,而血漿cfDNA中僅檢測到56.8%的驅(qū)動基因突變。在EGFR-TKIs治療過程中,非小細胞肺癌腦膜轉(zhuǎn)移患者顱內(nèi)獲得性耐藥突變與顱外病灶無關(guān)。由此可知,腦脊液cfDNA和血漿cfDNA的配對檢測可輔助腦膜轉(zhuǎn)移的非小細胞肺癌患者做出臨床決策。

 

image.png

泛生子于2018年發(fā)表在《Acta Neuropathologica》的研究成果,提出腦脊液循環(huán)腫瘤DNACSF-ctDNA)檢測法相對組織活檢,在腦干膠質(zhì)瘤的檢測上更便捷、可靠、安全。該成果填補了國際腦干膠質(zhì)瘤液體活檢領(lǐng)域空白,成為近年來腦干膠質(zhì)瘤診療最重要的突破之一。

 

 

 

目前,尿路上皮癌患者雖可在術(shù)前通過輸尿管鏡、膀胱鏡進行病理診斷,但因此增加的創(chuàng)傷和感染風險,及其檢查后與周圍組織粘連的可能性也明顯增加,并可能導致腫瘤擴散及術(shù)后復發(fā)。研究團隊基于尿液樣本,對150例血尿患者和100例健康人進行對比檢測,實現(xiàn)了94%的靈敏度和96%的特異性;而在另一項相關(guān)研究中,研究團隊基于尿液樣本,對109例血尿患者進行檢測,結(jié)果表明總體靈敏度、特異性、NPVPPV分別為83.5%90.0%67.5%95.7%。泛生子基于尿液樣本開發(fā)的尿路上皮腫瘤風險基因檢測panel展現(xiàn)了優(yōu)越的產(chǎn)品性能,使其有望成為尿路上皮癌輸尿管鏡、膀胱鏡的臨床替代產(chǎn)品。

 

在癌癥早篩領(lǐng)域,泛生子的研發(fā)成果及商業(yè)化節(jié)奏處于行業(yè)領(lǐng)先水平。

 

泛生子開發(fā)的Mutation Capsule技術(shù)可檢測廣泛的ctDNA變異類型,包括如SNV(單核苷酸位點變異)和小片段插入及缺失(Indels)等簡單變異,也包括如染色體易位、HBV整合、拷貝數(shù)變異、甲基化變化等復雜變異。該技術(shù)只需極少血樣,就能在不犧牲靈敏度的情況下對一個ctDNA樣品進行多種測試,解決了在多個不同回顧性研究中測試新的生物標志物的問題。據(jù)招股書披露,泛生子已經(jīng)在肝癌早篩領(lǐng)域與國家癌癥中心合作,啟動大規(guī)模前瞻性隊列研究,并加入科技部主導的肝癌、肺癌和消化道癌數(shù)個國家重大專項。泛生子在乙肝病毒攜帶者前瞻性隊列中進行肝癌早篩的研究成果,是唯一發(fā)表在國際頂級學術(shù)期刊的基于前瞻性隊列的研究成果,技術(shù)指標和性能處于世界領(lǐng)先地位。泛生子目前正在推進肝癌早篩產(chǎn)品的研發(fā)和注冊申報,有望成為中國癌癥早篩領(lǐng)域首個獲落地審批用于臨床的市場化產(chǎn)品。


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20193月,泛生子在乙肝病毒攜帶者前瞻性隊列中進行肝癌早篩的研究成果發(fā)表于《美國科學院院刊》(PNAS

 

隨著高通量基因測序技術(shù)的逐漸普及,對海量的測試數(shù)據(jù)進行大規(guī)模的數(shù)據(jù)分析是癌癥基因檢測面臨的又一課題。泛生子在數(shù)據(jù)分析領(lǐng)域引入了高級機器學習技術(shù),利用自主研發(fā)算法來優(yōu)化大多數(shù)NGS產(chǎn)品中的變量調(diào)用流程,將變量調(diào)用程序的靈敏度從95.6%提高到97.9%,精度從97.4%提高到98.6%;此外,泛生子還開發(fā)了自動化變量審閱器mutNET,取代基于機器學習框架的手動變量審閱過程。mutNET減少了手動審閱過程中由于人為判斷造成的可變性,并節(jié)約了95%的審閱時間,為處理海量數(shù)據(jù)提供了技術(shù)保障。

 

空談技術(shù)創(chuàng)新而無法達成其成果轉(zhuǎn)化及商業(yè)化,是很多所謂“PPT”、“噱頭”型科創(chuàng)企業(yè)難以走出的困境。與之相反,泛生子著力推動轉(zhuǎn)化醫(yī)學研究,基于多項國際領(lǐng)先的技術(shù)成果,打造了“LDT+IVD”雙軌并行的業(yè)務模式,服務及產(chǎn)品覆蓋從癌癥早篩到診斷及治療指導,再到監(jiān)測及預后管理的癌癥全周期,涉及中國前10大高發(fā)癌癥中的8種。在IVD產(chǎn)品開發(fā)方面,泛生子目前已有七款產(chǎn)品獲 NMPA 批準應用于臨床,覆蓋NGSdPCR qPCR 三大技術(shù)平臺。目前在獲批IVD產(chǎn)品的數(shù)量上,泛生子處于行業(yè)內(nèi)的絕對領(lǐng)先地位。在檢測服務方面,泛生子已于國內(nèi)500余家醫(yī)院實現(xiàn)廣泛覆蓋,服務數(shù)萬名患者,力推其創(chuàng)新技術(shù)在臨床診療中快速普及和應用,讓更多患者從中獲益。


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